水界環境を汚染したり有害な作用をおよぼす微細藻には
　　　　(1)飲料水の水質を悪化させるもの
　　　　(2)景観の破壊につながるもの
　　　　(3)悪臭をもたらすもの
　　　　(4)ある種の有毒成分を含む飛沫によって健康障害をひきおこすもの
　　　　(5)施設、機械、漁網などに着生して、汚損させるものなどが挙げられる。
　景観破壊の点からは赤潮の原因になるすべての微細藻がこの中に入ることになる。