好冷細菌ともよばれ、発育の適温が低温にある細菌。低温の限界を0℃と5-7℃とする考え方がある。1960年頃から北極海や南極近海、さらに深海の海水から多くの細菌が分離されるようになって、20℃以上でも増殖できる通性好冷菌と、より低温でのみ増殖できる偏性好冷菌に分けられている。低温細菌は地球上に広く分布し種類も多い。おもな低温細菌としてグラム陰性菌ではシュードモナス、ビブリオ、エロモナス、アルカリゲネス、アシネトバクター、モラキセラ、フラボバクテリウム、エンテロバクターがあり、グラム陽性菌ではミクロコッカス、コリネ型細菌、乳酸菌、放線菌などがある。なお、低温真菌(かびや酵母)も多く、これらをまとめて低温菌とよばれている。